1、按工作流程划分
　　标本取材室、脱水透明浸蜡与包埋室，切片室，染色室，特殊染色和免疫组化室（分子病理室）。

2、按气流布局划分
　　清洁区、半清洁区和污染区，污染和半污染区之间的缓冲区。

3、按功能作用划分
　　（1）污染区：（生物因素与化学制剂污染）标本收取、巨检和取材室，冰冻切片室；
　　（2）相对清洁区/缓冲区：（化学制剂污染）常规制片室，特殊染色和免疫组化室，分子实验室；
　　（3）相对危险区：（防火区）有毒易燃物品储藏室；
　　（4）清洁区：诊断室，档案室，办公室。

提醒
　　将各区分开，污染区和相对清洁区设计独立的排风及排污系统；另设门禁系统，无关人员和无关物品不得进入污染区和相对清洁区。